Jellyfishers tiene lugar en un mundo lleno de criaturas llamadas Jellies que se parecen a las medusas. Hay demasiadas en la Tierra, por lo que tu misión es capturar a tantas como puedas para llevarlas de regreso a Jelly-nate, su planeta.
Para capturarlas tendrás que comprar comida para tu playa y luego esperar a que vengan. Una vez aparezcan, podrás capturarlas mediante un minijuego. Las Jellies que vienen varían según el lugar y la comida. La gran mayoría de ellas pueden crecer después de capturar un determinado número de ellas. El juego se irá volviendo más difícil a medida que avances, pero no te preocupes, ¡podrás adquirir complementos para tu personaje y las playas para ayudarte!